本篇公開一種指紋電子存包柜系統及其控制方法。該指紋電子存包柜系統包括帶有多個柜門的柜子；柜子內有一個ARM9嵌入式計算機系統主板，該嵌入式計算機系統主板與電源、信息識別模塊、紅外物體感應模塊、語音提示模塊、液晶顯示器及多個電磁鎖相連接；各電磁鎖分別安裝在各個柜門內；紅外物體感應模塊與多個紅外物體感應探頭相連接，其中一個紅外物體感應探頭安裝在柜子前側，每個柜門內分別裝有一個或多個紅外物體感應探頭。本電子存包柜系統可單機或聯網使用，適用于企事業單位的機密文件保管，銀行保管業務、保管箱業務，機關、醫院等行業的員工更衣柜以及酒店、超市、娛樂場所等客流量大、流動性強的場所。